• 第一篇
• 第一章　生態工程學的時代背景
• 第二章　生態與工程間的鴻溝
• 第三章　工程與生態的結合—奧登兄弟的貢獻
• 第四章　生態工程的實踐—人工濕地
• 第五章　就地取材整治河川
• 第六章　台灣農田水利古典砌石工法
• 第七章　生態工程在台灣的發展
• 第二篇　集水區溪河生態工程核心理論
• 第一章　復育河川生態的核心理論（一）營養螺旋概念
• 第二章　復育水域的核心理論（二）河川連續概念整治
• 第三章　復育水域生態的理論（三）洪水脈衝概念
• 第四章　復育河川生態的核心理論（四）人工誘導概念
• 工程範例：集水區生態工程除磷經典之作─佛羅里達州ENR
• 第三篇 人工溼地理論
• 第一章　工作團隊裡的成員是哪些人？
• 第二章　如何選對場址？
• 第三章　生態工程的特殊結構—地下水流濕地
• 第四章　生態工程的特殊結構—自由表面流濕地
• 第五章　生態工程的特殊結構—人工浮島
• 第六章　生態工程評估
• 第四篇 人工濕地在河濱的建造
• 第一章 如何在河濱建造人工濕地
• 第二章 在河濱灘地促進河川自淨作用的生態風險
• 第三章 自然淨化處理與傳統污水處理的異同
• 第四章 河濱灘地營建提高溪流自淨作用生態工法的種類
• 第五章 生態系統與人工濕地的關係
• 第六章 處理污水與生態保育人工濕地的差異
• 第七章 污水處理型的人工濕地兼具生態棲地的功能
• 第八章 人工濕地建造的風險與最可能失敗的原因
• 第九章 如何喚起地方民眾對於污水處理型人工濕地的支持
• 第十章 由河川水質因子做判斷
• 第五篇 工程中的生態學
• 生態學－－第一講、生態學概論
• 生態學－－第二講、生物間的差異
• 生態學－－第三講、氣候與微氣候
• 生態學－－第五講、土壤的生態功能 （增訂）
• 生態學－－第六講、植物在逆境時生理與形態的適應
• 生態學－－第七講、不同生態系統的有機物分解
• 生態學－－第八講、動物營養與生態之關係
• 生態學－－第九講、生物地理化學循環
• 生態學－－第九講、動物需氧量與生態環境之維護
• 生態學－－第九講、營養份循環
• 生態學－－第十講、水域生態系動物回饋機制與存在環境的適應
• 生態學－－第十三講、熱對生物的影響
• 生態學－－第十四講、種群學
• 生態學－－第十五講、生物族群空間分佈之統計判斷
• 生態學－－第十六講、族群在時間上的變異
• 生態學－－第十七講、族群密度制約
• 生態學－－第十八講、生物的繁殖對於棲地的需求
• 生態學－－第十九講、棲位分析
• 生態學－－第二十講、有限混合機率分佈解優勢流速對生物物種之影響
• 生態學－－第二十一講、不同物種的競爭
• 生態學－－第二十二講、生物多樣化指數
• 生態學－－第二十三講、生物物種均勻度
• 生態學－－第二十四講、陸域生態學
• 生態學－－第二十五講、森林生態
• 生態學－－第二十六講、陸域生態(II)
• 生態學－－第二十七講、陸域生態學(III)
• 生態學－－第二十八講、陸域生態學(IV)沙漠生態系統
• 生態學－－第二十九講、陸域生態學(V)
• 生態學－－第三十講、水域生態系(V)
• 生態學－－補助講義─烏龜溼地
• 生態學的關鍵思索─生物與礦物間的關聯
• 習題－－如何復育青蛙的棲地？
• 第六篇 生態系統理論與工程
• 第一章、大自然中有一個看不見的尺度—田斯利生態系統的產生
• 第二章、泥碳湖邊的徘徊—生態系統與食物鏈
• 第三章、獨輪車上的天才—生態系統與生物多樣性
• 第四章　格林尼爾的棲地理論
• 第五章　調控理論
• 第六章 生態系統發展論
• 第七章 外生演替理論
• 第八章 生態工程的能量觀
• 第七篇　生態工法在台灣的實例
• 第一章 表面流人工濕地處理污水成效之評估
• 第二章 礫間接觸水質淨化處理污水成效之評估
• 第三章 地下滲濾水質處理成效之評估
• 第四章 台灣人工濕地水生植物的栽種與去除污染效率評估
• 第五章 台灣河川水質淨化工程的維護管理與評估方法

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